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“数源杯”百万单细胞基因表达数据算法大赛决赛在深举行 10组国内外高校团队 展开“BT+IT”较量

来源: 深圳商报   2021-08-17 09:19:28

读特客户端•深圳新闻网2021年8月17日讯(深圳商报记者 张妍 通讯员 田娇)8月16日,“数源杯”百万单细胞基因表达数据算法大赛在深圳国家基因库举行决赛,来自国内外10所高校的10组精英团队在此展开一场关于“BT+IT”的较量。

据了解,该赛事由深圳国家基因库主办,深圳华大生命科学研究院、深圳市猛犸公益基金会、深圳市华大基因学院协办,旨在提升单细胞聚类算法的性能。

深圳国家基因库主任王韧表示,从2009年第1篇单细胞转录组测序文章横空出世至今,短短10余年间单细胞测序技术在生命科学研究各层面都获得了快速、广泛的应用,单细胞测序技术的发展也日新月异。“随着单细胞数据的不断产出,数据处理的通量不断攀升,这意味着单细胞计算工具的性能也需要不断提升,方能满足该领域飞速发展的需求。”

深圳国家基因库生命大数据平台负责人魏晓锋表示,深圳国家基因库本身就是以生命大数据和大样本存储为根基的国家基因库,希望以举办该赛事为契机,让更多领域的科研人员更好地利用相关资源,更好地挖掘相关信息。该赛事吸引了全球300余支队伍报名参与,累计提交作品达1819件次,最终经过初赛、复赛的严格评审筛选,10支队伍入围决赛。

“我们最终目的是希望推动应用,比如精准医学、精准农业育种等。”魏晓锋表示,该赛事产生的算法工具将部署到生命大数据平台上,免费提供给医疗机构和科研机构人员使用。

BT指的是生物技术,IT则是信息技术,“BT+IT”的融合则可能是下一个产业的爆发点。华大集团首席科学家、华大生命科学研究院院长徐讯在赛事发言中透露,科技部的“十四五”重点研发计划上已启动了“BT+IT”融合项目。

徐讯认为,“BT+IT”融合包括两方面内容,一是利用生物技术来突破信息技术的局限。目前,没有任何一种存储介质可以像DNA一样把信息储存上百万年的时间,如果用AGCT 4种碱基字符作为编码来取代计算机存储格式,存储年限将远超过目前的磁介质和光介质。二是利用信息技术解决生物技术的问题,“这就是今天比赛的内容之一,而这仅仅是一个开端。”

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